小工厂最怕的部门查包括：质量部门：产品质量的好坏直接影响到产品的销量和信誉。一旦出现质量问题，可能导致销量下降，社会不再认可和信任，甚至可能导致工厂倒闭。劳动监察部门：劳动监察大队有权对工厂进行行政处罚，特别是如果工厂存在拖欠工人工资的现象。应急管理局：应急管理局负责安全生产监督管理工作，其安监大队